赛菲罗斯的事件已经过去2年了，人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍，但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德，却过着与世隔绝的生活。　　但是，神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法?洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时，眼前这个人，只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。　　以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前，文森特不得不再次...

9岁的人类少年莲（宫崎葵 配音）痛失母亲，他拒绝亲戚的照顾，独自跑上熙攘的大街，偏巧遇到了偶然来人间寻找弟子的怪物熊彻（役所广司 配音）。怪物界的宗师（津川雅彦 配音）即将转生为神，接任他位置的人选将在猪王山（山路和弘 配音）和熊彻之间产生，但是没有嫡传弟子让熊彻希望渺茫。借此机缘，莲闯入了怪物世界，他和熊彻之间争吵不断，可是在冲突的过程中似乎又渐渐认同彼此。转眼间莲（染谷将太 饰）已成长为武功高...